Η Επιτροπή Προγράμματος Σπουδών ασκεί τις αρμοδιότητες της Συνέλευεσης της Σχολής, καθότι πρόκειται για Διατμηματικό Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών. Συγκροτείται με απόφαση της Συγκλήτου του Ε.Κ.Π.Α., κατόπιν εισήγησης των Συνελεύσεων των συνεργαζόμενων Τμημάτων και αποτελείται από μέλη Διδακτικού Ερευνητικού Προσωπικού (Δ.Ε.Π.). Ο αριθμός των μελών και η σύνθεσή της καθορίζονται στο Πρωτόκολλο συνεργασίας μεταξύ της Ιατρικής Σχολής και του Τμήματος Φαρμακευτικής.
Πρόεδρος της Επιτροπής Προγράμματος Σπουδών, βάσει του Εσωτερικού Κανονισμού Λειτουργίας του Δ.Π.Μ.Σ. "Νανοϊατρική" ορίζεται ο Διευθυντής του Δ.Π.Μ.Σ.:
Τα υπόλοιπα μέλη της Επιτροπής Προγράμματος Σπουδών είναι:
Διευθυντής του Διατμηματικού Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών "Νανοϊατρική" είναι ο καθηγητής Ιατρικής Φυσικής της Ιατρικής Σχολής του ΕΚΠΑ, Ευστάθιος Ευσταθόπουλος. Είναι Υπεύθυνος Ακτινοπροστασίας στο Ακτινολογικό Εργαστήριο και στο Εργαστήριο Πυρηνικής Ιατρικής, καθώς επίσης και Υπεύθυνος της Μονάδας Ακτινοφυσικής του Β’ Εργαστηρίου Ακτινολογίας της Ιατρικής Σχολής του ΕΚΠΑ, Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο «Αττικόν». Είναι επίσης ιδρυτικό μέλος και Πρόεδρος της Ελληνικής Εταιρείας Νανοτεχνολογίας στις Επιστήμες Υγείας (ΕΛΕΝΕΠΥ, www.hsnanohs.eu).
Αναπληρωτής Διευθυντής του Διατμηματικού Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών "Νανοϊατρική" είναι ο καθηγητής Φαρμακευτικής Νανοτεχνολογίας του Τμήματος Φαρμακευτικής του ΕΚΠΑ, Κωνσταντίνος Δεμέτζος. Είναι διευθυντής του Εργαστηρίου Φαρμακευτικής Τεχνολογίας και Πρόεδρος της Ελληνικής Φαρμακευτικής Εταιρείας.