Οι Στρατηγικοί Στόχοι για κάθε άξονα δραστηριότητας του Δ.Π.Μ.Σ. Νανοϊατρική, ακολουθούν αυτούς που έχουν καθοριστεί συλλογικά για τα Δ.Π.Μ.Σ. της Ιατρικής Σχολής του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών και είναι οι εξής:
Οι προαναφερθέντες στόχοι συνοδεύονται από ειδικότερες δράσεις, οι οποίες σχεδιάζονται βάσει των ιδιαιτεροτήτων του Δ.Π.Μ.Σ. «Νανοϊατρική» και αποτιμώνται με δείκτες μέτρησης. Στην ετήσια Στοχοθεσία του Δ.Π.Μ.Σ., καθορίζονται οι δείκτες αποτελεσματικότητας και αποδοτικότητας, ενώ δύναται να επαναπροσδιορίζονται ή/και προστίθενται συναφείς Στόχοι Ποιότητας και Ενέργειες/Δράσεις για την υλοποίηση αυτών, για τους καθορισμένους Στρατηγικούς Στόχους. Οι δράσεις των Δ.Π.Μ.Σ. της Σχολής, έχουν στόχο την ακαδημαϊκή ανάπτυξη και είναι συνυφασμένες με το Συνολικό Στρατηγικό Σχέδιο του Ιδρύματος.
Ο προγραμματισμός/καθορισμός των στόχων και των δράσεων στο Δ.Π.Μ.Σ. "Νανοϊατρική", είναι σύμφωνος με την εγκεκριμένη στοχοθεσία ποιότητας.